Площадь заповедника 659912 га . Административно-научный центр заповедника находится в Иркутске. Климат заповедника в целом континентальный.
Флора и фауна
Флора заповедника насчитывает около 130 видов грибов, 920 видов сосудистых растений . На побережье Байкала сохранились фрагменты древних реликтовых степей, покрытая лесом площадь составляет 86 % от всей территории заповедника .На склонах Байкальского хребта отчетливо выражена высотная поясность растительности.
Фауна птиц заповедника насчитывает 235 видов, из них 146 гнездящихся .
В заповеднике обитает 52 вида млекопитающих.
Байкальская нерпа регулярно встречается у заповедного побережья Байкала .